候选靶点功能验证
靶点干预是否改变疾病相关表型?哪些结果支持继续投入?
靶点发现服务 · 功能基因组学
基于PDO 1.0与PDO 2.0双平台,连接肿瘤细胞内在机制与微环境功能,开展靶点发现、基因文库筛选与功能验证研究。
围绕您的研发目标配置模型、基因干预与功能验证,以清晰的阶段目标和交付推进靶点发现项目。
研发决策
靶点干预是否改变疾病相关表型?哪些结果支持继续投入?
特定分子背景可能依赖哪些基因?这些依赖性是否具有选择性?
哪些变化与耐药相关?哪些干预值得进一步开展联合研究?
肿瘤或免疫细胞的干预如何影响识别与杀伤?可选择哪些模型和检测进行验证?
PDO 1.0 + PDO 2.0 · 双平台研究
两类模型均可作为靶点研究的起点。围绕研究问题匹配模型、基因干预与功能读数,既可独立开展研究,也可组合用于跨体系的发现与验证。
PDO 1.0
围绕肿瘤细胞生长、存活与药物反应,设计候选基因验证、基因文库筛选及耐药机制研究,建立靶点与肿瘤表型之间的功能联系。
比较PDO 1.0与PDO 2.0 ↗PDO 2.0 / ALI
结合模型中的组织结构、免疫组成与分子特征,提出微环境相关靶点假设,设计肿瘤—免疫相互作用、免疫识别与杀伤及药物反应研究。
了解PDO 2.0 / ALI研究体系 ↗从疾病与分子背景提出假设,选择合适的模型和检测筛选候选,再结合PDO 1.0肿瘤表型与PDO 2.0微环境读数开展功能验证,形成支持靶点优先级和联合研发的证据。
基因文库筛选与靶点优选
围绕疾病机制、药物敏感性与耐药问题,设计类器官基因扰动与文库筛选研究,结合分子特征、功能表型和独立验证,发现并优选具有研发价值的候选靶点。
PDO 1.0 / PDO 2.0
按研究问题匹配候选基因 · 通路 · 对照
确定筛选范围递送与干预确认
建立实验分组测序或表型读出
形成候选排序肿瘤表型 · 微环境功能
支持研发决策连接基因扰动与生长、存活及药物反应,识别值得复验的候选基因。
围绕疾病相关通路或候选基因集设计聚焦文库研究,识别影响类器官生长与存活的候选依赖基因。
比较药物处理与对照条件下的基因扰动效应,探索敏感性、耐药机制和联合干预方向。
对筛选候选开展独立基因干预,结合分子确认、功能读数及独立模型复验,形成靶点优先级依据。
研究设计涵盖CRISPR或RNA干扰等基因扰动策略。结合目标基因集、模型特征与试点数据,共同确定文库类型、筛选规模、对照设置及测序或表型读出方案。
讨论文库筛选方案 ↗TRiCBIO研究结果
01 · 靶点与模型匹配
在统一染色条件下比较候选组织的TGF-β1表达,可选择代表不同靶点表达背景的样本进入后续PDO药物与机制研究。
据此规划后续研究需要比较的靶点表达背景。
查看大图02 · 基因递送与表达
通过比较Scramble shRNA对照与lncRNA shRNA条件下的类器官形态和表达信号,为后续分子确认与功能研究选择实验条件。
了解基因递送与干预研究 ↗03 · 细胞组成与分子背景
肝癌原组织与PDO的配对单细胞分析呈现各样本中的T细胞相关群体、B细胞及巨噬细胞等组成,明确免疫相关靶点研究可利用的模型背景。
据此选择机制研究与药物评价需要的检测指标。
团队研究基础
团队成员参与的Nature Medicine研究展示了如何推进候选因子的功能验证:在Apc缺失的小鼠结肠类器官中比较Igf2、miR-483及其组合,并用组织学、增殖与侵袭结果评估候选驱动因子的功能。
Li et al., Nature Medicine, 2014 · Fig. 5 ↗合作方式
围绕您的靶点、候选药物与研发问题,定制模型、筛选和验证方案,提供实验数据、分析报告与后续研究建议。
讨论靶点发现项目 ↗结合双方的模型、数据、技术与候选药物资源,共同发现和验证靶点,研究作用机制,推进具有开发价值的研究项目。
探讨联合研发合作 ↗以靶点证据和候选药物研究为基础,与合作伙伴共同推进联合发现、功能验证,并探索具有开发价值的药物联合开发机会。
行业进展
2026年8月发表于Nature的三项同行评议研究展示了三个与项目设计直接相关的方向:扩大患者来源模型资源、在类器官中开展全基因组CRISPR筛选,以及将新的癌症亚型和状态纳入依赖性图谱。
这些公开研究主要基于PDO 1.0及其他NextGen三维癌症模型,可为模型覆盖、筛选规模和命中验证提供参照;涉及组织结构、免疫背景或微环境功能的问题,还可进一步评估PDO 2.0研究方案。
建立665个患者来源模型,覆盖25种癌症并连接临床与多组学注释,为后续功能研究提供模型资源。
建立并表征256个肿瘤类器官,通过其中162个模型的全基因组CRISPR筛选绘制癌症依赖性。
在10种癌症的类器官与肿瘤球中完成147项全基因组CRISPR筛选,将新的分子亚型和状态相关依赖性纳入DepMap。
初次沟通可分享非机密的疾病或癌种、候选靶点、已有模型与数据,以及希望支持的研发决策。
讨论靶点发现项目靶点发现服务 · 功能基因组学
基于PDO 1.0与PDO 2.0双平台,连接肿瘤细胞内在机制与微环境功能,开展靶点发现、基因文库筛选与功能验证研究。
围绕您的研发目标配置模型、基因干预与功能验证,以清晰的阶段目标和交付推进靶点发现项目。
研发决策
靶点干预是否改变疾病相关表型?哪些结果支持继续投入?
特定分子背景可能依赖哪些基因?这些依赖性是否具有选择性?
哪些变化与耐药相关?哪些干预值得进一步开展联合研究?
肿瘤或免疫细胞的干预如何影响识别与杀伤?可选择哪些模型和检测进行验证?
PDO 1.0 + PDO 2.0 · 双平台研究
两类模型均可作为靶点研究的起点。围绕研究问题匹配模型、基因干预与功能读数,既可独立开展研究,也可组合用于跨体系的发现与验证。
PDO 1.0
围绕肿瘤细胞生长、存活与药物反应,设计候选基因验证、基因文库筛选及耐药机制研究,建立靶点与肿瘤表型之间的功能联系。
比较PDO 1.0与PDO 2.0 ↗PDO 2.0 / ALI
结合模型中的组织结构、免疫组成与分子特征,提出微环境相关靶点假设,设计肿瘤—免疫相互作用、免疫识别与杀伤及药物反应研究。
了解PDO 2.0 / ALI研究体系 ↗从疾病与分子背景提出假设,选择合适的模型和检测筛选候选,再结合PDO 1.0肿瘤表型与PDO 2.0微环境读数开展功能验证,形成支持靶点优先级和联合研发的证据。
基因文库筛选与靶点优选
围绕疾病机制、药物敏感性与耐药问题,设计类器官基因扰动与文库筛选研究,结合分子特征、功能表型和独立验证,发现并优选具有研发价值的候选靶点。
PDO 1.0 / PDO 2.0
按研究问题匹配候选基因 · 通路 · 对照
确定筛选范围递送与干预确认
建立实验分组测序或表型读出
形成候选排序肿瘤表型 · 微环境功能
支持研发决策连接基因扰动与生长、存活及药物反应,识别值得复验的候选基因。
围绕疾病相关通路或候选基因集设计聚焦文库研究,识别影响类器官生长与存活的候选依赖基因。
比较药物处理与对照条件下的基因扰动效应,探索敏感性、耐药机制和联合干预方向。
对筛选候选开展独立基因干预,结合分子确认、功能读数及独立模型复验,形成靶点优先级依据。
研究设计涵盖CRISPR或RNA干扰等基因扰动策略。结合目标基因集、模型特征与试点数据,共同确定文库类型、筛选规模、对照设置及测序或表型读出方案。
讨论文库筛选方案 ↗TRiCBIO研究结果
01 · 靶点与模型匹配
在统一染色条件下比较候选组织的TGF-β1表达,可选择代表不同靶点表达背景的样本进入后续PDO药物与机制研究。
据此规划后续研究需要比较的靶点表达背景。
查看大图02 · 基因递送与表达
通过比较Scramble shRNA对照与lncRNA shRNA条件下的类器官形态和表达信号,为后续分子确认与功能研究选择实验条件。
了解基因递送与干预研究 ↗03 · 细胞组成与分子背景
肝癌原组织与PDO的配对单细胞分析呈现各样本中的T细胞相关群体、B细胞及巨噬细胞等组成,明确免疫相关靶点研究可利用的模型背景。
据此选择机制研究与药物评价需要的检测指标。
团队研究基础
团队成员参与的Nature Medicine研究展示了如何推进候选因子的功能验证:在Apc缺失的小鼠结肠类器官中比较Igf2、miR-483及其组合,并用组织学、增殖与侵袭结果评估候选驱动因子的功能。
Li et al., Nature Medicine, 2014 · Fig. 5 ↗合作方式
围绕您的靶点、候选药物与研发问题,定制模型、筛选和验证方案,提供实验数据、分析报告与后续研究建议。
讨论靶点发现项目 ↗结合双方的模型、数据、技术与候选药物资源,共同发现和验证靶点,研究作用机制,推进具有开发价值的研究项目。
探讨联合研发合作 ↗以靶点证据和候选药物研究为基础,与合作伙伴共同推进联合发现、功能验证,并探索具有开发价值的药物联合开发机会。
行业进展
2026年8月发表于Nature的三项同行评议研究展示了三个与项目设计直接相关的方向:扩大患者来源模型资源、在类器官中开展全基因组CRISPR筛选,以及将新的癌症亚型和状态纳入依赖性图谱。
这些公开研究主要基于PDO 1.0及其他NextGen三维癌症模型,可为模型覆盖、筛选规模和命中验证提供参照;涉及组织结构、免疫背景或微环境功能的问题,还可进一步评估PDO 2.0研究方案。
建立665个患者来源模型,覆盖25种癌症并连接临床与多组学注释,为后续功能研究提供模型资源。
建立并表征256个肿瘤类器官,通过其中162个模型的全基因组CRISPR筛选绘制癌症依赖性。
在10种癌症的类器官与肿瘤球中完成147项全基因组CRISPR筛选,将新的分子亚型和状态相关依赖性纳入DepMap。
初次沟通可分享非机密的疾病或癌种、候选靶点、已有模型与数据,以及希望支持的研发决策。
讨论靶点发现项目